クロクサアリ Lasius fuji complex |
AAntBOLは、アジア産アリ類DNA barcodeデータベースです。DNAバーコードは特定の遺伝子領域の短い塩基配列を用いて生物種の同定を促進する手法で、動物では、ミトコンドリアゲノム上のCOI遺伝子の5′端約650塩基長が標準的なバーコード領域とされています。昆虫類ではチョウ目、ハエ目、ハナバチ類等で進められています。
AAntBOL はDNA バーコードデータとして、 LCO/HCOプライマーを用いた動物に一般的なCOIバーコード領域および他の領域を用いています。AAntBOLのデータ数は2015年2月16日現在 108件あります。これらのデータはいずれもbarcodeデータとともに、その証拠標本がGBIF(地球規模生物多様性情報機構)の標準書式 Darwin Core に従って作成され、学名、採集年月日、採集地、採集者等40項目を収録しています。今後順次データを蓄積し公開の予定です。
AAntBOLは、テキストデータベース管理システムSIGMAにより運用されています。
本データベースは日本学術振興会の科学研究費研究成果公開促進費(データベース)(代表者:多田内 修)の補助を受けています。
本データベースは、研究・教育用に無料で公開しています。
データの項目とタグは下記の40項目です。
1. | (DATE) | Date Last Modified |
2. | (SID) | DNA Sample ID |
3. | (AAntBOLID) | AAntBOL ID |
4. | (GenBank) | GenBank Accesssion No. |
5. | (BOLD) | BOLD ID |
6. | (GEN) | Genome |
7. | (LOCUS) | Locus |
8. | (PCR) | PCR Primers |
9. | (SEQ) | Sequence |
10. | (IST) | Institution Code |
11. | (COLC) | Collection Code |
12. | (NAME) | Scientific name |
13. | (JPNAME) | Japanese name |
14. | (BR) | Basis of Record |
15. | (KING) | Kingdum |
16. | (PHY) | Phylum |
17. | (CL) | Class |
18. | (OR) | Order |
19. | (FAM) | Family |
20. | (GEN) | Genus |
21. | (SP) | Species |
22. | (SSP) | Subspecies |
23. | (AU) | Scientific Name Author |
24. | (IDENT) | Identification By |
25. | (YIDENT) | Year Identified |
26. | (TYPES) | Type Status |
27. | (COL) | Collector |
28. | (COLD) | Collecting Date |
29. | (C) | Country |
30. | (STATE) | State Province |
31. | (COUNT) | County |
32. | (LOC) | Locality |
33. | (LON) | Longitude |
34. | (LAT) | Latitude |
35. | (SEX) | Sex |
36. | (TYPE) | Preparation Type |
37. | (RCAT) | Related Catalog Item |
38. | (SDEP) | Specimen Depository |
39. | (PUB) | Publication |
40. | (NOTE) | Notes |
Date Last Modified | 2014 02 11 |
DNA Sample ID | MM-LAS002 |
AAntBOL ID | |
GenBank Accesssion No. | |
BOLD ID | |
Genome | Mitochondrial |
Locus | COI (cytochrome c oxidase subunit I) |
PCR Primers | LCO1490/HCO2198 |
Sequence | GATGTTGATATAAAATAGGGTCCCCACCACCTGATGGGTCAAAAAATGAAGTATTAAGGTTACGGTCGGTTAAGAGTATT GTAATAGCTCCTGCTAAAACAGGAAGAGATAAAAGTAATAAAATTGCGGTAATTAAAATTGATCAGACAAGTAAGGGAAT TTTGTCAATAGAAAAATTTTTATGATGTATATTTATAATAGTTGAAATGAAATTAATTGCCCCTAGAATGGAAGATATTC CAGCAATATGAAGAGAAAAAATAGTTAAATCAATTGAGGGGCCATTATGAAAAATGTTTGAAGCTAATGGTGGATAAACT GTTCATCCTGTCCCTACTCCGTCATTGATGAAATTTCTTAAGAGAAGAAGAGAGATTGAAGGTGGTAAAAGTCAGAATCT TATATTATTTATTCGAGGGTACGCTATATCAGGTGATCCTAATATTAAAGGTACAAGAAAATTTCCGAATCCCCCAATTA TAAAAGGTATAACTATAAAAAAAATTATAATGAATGCGTGTCTTGTAATTATAGAGTTATAAATTTGATCATTGTTAATA AGTGAATTTGATGAGCCCAGTTCTAATCGGATGATTATTCTTATAGAAGAACCAATCATACCGGCTCAAATAGCAAATAA AAAGTAAAGAATTCCAATATCTTTATGGATTTGTTGACCAC |
Institution Code | KUM |
Collection Code | |
Scientific name | Lasius fuji complex |
Japanese name | クロクサアリ |
Basis of Record | S(標本); G(遺伝資源) |
Kingdum | Animalia |
Phylum | Arthropoda |
Class | Insecta |
Order | Hymenoptera |
Family | Formicidae |
Genus | Lasius |
Species | cf. fuji |
Subspecies | |
Scientific Name Author | Radchenko, 2005 |
Identification By | M. Maruyama |
Year Identified | 2009 |
Type Status | |
Collector | Maruyama-M |
Collecting Date | 2006/05/04 |
Country | JP(JAPAN) |
State Province | Yamanashi |
County | Koshu-shi |
Locality | Enzan-kamihagiwara (450m), Koshu-shi, Yamanashi Pref., Honshu |
Longitude | |
Latitude | |
Sex | Female |
Preparation Type | |
Related Catalog Item | |
Specimen Depository | Kyushu University |
Publication | |
Notes |
出版物・利用マニュアル・解説として、下記のものがあります。
Tadauchi, O., C. Hirosawa, H. Inoue, T. Sugimoto, R. Murao, N. Takahashi, S. Sato, K. Mitai and Y. Hara, 2009. Specimen database AIIC, Asian insect information center database, based on types and normal specimens collected in Asia and the Pacific Area, Part 1. Esakia, (49): 1-5.
本データベースの著作権は、昆虫学データベース作成グループ(代表:多田内修、編集者:丸山宗利、藤原希美、板谷弘樹、システム管理: 井上仁、上塘深)に帰属します。本データベースの複製・転載・販売等の二次利用を堅くお断りします。
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